文獻速遞?|?泓迅生物Oligo?Pools?再助力!
2022年全球寡核苷酸庫(含Oligo Pools)市場規(guī)模達28.34億元,貝哲斯咨詢預測到2028年,全球寡核苷酸庫市場規(guī)模預計將達40.94億元。
為什么Oligo Pools發(fā)展如此迅速?
主要的驅動力來自基因治療、癌癥早篩、農業(yè)育種及合成生物學等應用的商業(yè)化落地,而Oligo Pools(寡核苷酸池)因其高通量、低成本、高度可定制化的特性,成為上述應用在研究的核心工具之一。比如CRISPR文庫篩選在藥物靶點發(fā)現(xiàn)中的普及,顯著拉動了Oligo Pools的需求。此外,在突變體庫構建、NGS雜交捕獲探針文庫、合成生物學和DNA儲存等方向Oligo Pools也應用廣泛。
Oligo Pools應用解析
01. CRISPR基因編輯
CRISPR/Cas9是一種革命性的基因編輯工具,而Oligo Pools在其應用中扮演著重要角色。通過Oligo Pools建立sgRNA文庫,可以篩選出對目標基因編輯效果最佳的sgRNA序列。
02. 突變體庫構建
通過Oligo Pools,研究人員能夠合成大量含有不同突變的DNA片段,從而創(chuàng)建突變體庫,用于篩選出具備優(yōu)異功能的蛋白質或基因調控序列。
03. NGS雜交捕獲探針文庫
NGS建庫時,通過Oligo Pools合成構建雜交捕獲探針文庫,既可以用于目的基因的捕獲與檢測,也可以用于篩選靶序列的特異性探針序列。
04. 熒光原位雜交(FISH)
Oligo Pools通過高通量合成,在短時間內生成大量的具有不同序列的探針,可以覆蓋目標區(qū)域的多個位點,提高FISH檢測的靈敏度和準確性。
05. 合成生物學和DNA數(shù)據(jù)儲存
在合成生物學中,研究人員可以通過Oligo Pools合成DNA片段,并利用DNA拼接技術將其組裝成更大的DNA結構,快速實現(xiàn)多基因合成或途徑優(yōu)化。此外,隨著DNA儲存技術的發(fā)展,Oligo Pools的高通量合成能力使其成為DNA數(shù)據(jù)存儲的理想解決方案。
泓迅Oligo Pools助力PNAS文章
泓迅生物助力中山大學研究團隊2025年在PNAS(IF:11.25)上發(fā)表《The LIM-domain-only protein LMO2 and its binding partner LDB1 are differentially required for class switch recombination》,此研究將Oligo Pools技術應用在CRISPR基因編輯上:研究團隊通過CRISPR基因編輯介導的大規(guī)?;蚝Y選發(fā)現(xiàn)并確認了LMO2和LDB1是小鼠成熟B細胞系CH12F3和原代B細胞中的CSR因子。LMO2至少通過促進DNA雙鏈斷裂(DSBs)的末端連接并抑制末端去除,部分促進CSR。盡管LDB1穩(wěn)定LMO2蛋白,但它并不直接參與末端連接,而是作為AID轉錄的正調控因子,且其作用與LMO2無關,這一功能需要LDB1的二聚化結構域。此外,LDB1通過二聚化直接結合AID啟動子并促進AID啟動子與上游增強子的環(huán)化。
泓迅生物為該研究中的CRISPR基因編輯介導的大規(guī)模基因篩選實驗提供了sgRNA Oligo Pools的合成。合成的Oligo Pools通過PCR擴增后,被克隆到慢病毒載體中,形成CRISPR文庫。這一文庫是篩選B細胞中CSR關鍵基因(如LMO2和LDB1)的基礎工具。CRISPR文庫具有高通量、高特異性、完全敲除能力和可擴展性,可進行大規(guī)模篩選,作者通過該技術不僅驗證了已知CSR基因,還揭示了LMO2/LDB1在DSB修復和轉錄調控中的獨立功能,為抗體多樣化機制提供了新見解。
泓迅生物Syno?高通量合成平臺利用噴墨技術在芯片上單次平行合成高達100萬條寡核苷酸序列,最長可達300 nt。精湛的工藝可確保芯片合成均一性高,“五高”優(yōu)勢完美匹配客戶下游實驗和應用,提高后續(xù)高通量篩選效率和成功率:
√ 高通量:單次平行合成高達百萬條序列
√ 高精度:錯誤率低至1:500/nt
√ 高覆蓋度:目標序列100%覆蓋
√ 高均一性:90%以上的寡核苷酸在2.5倍以內的差異
√ 高性價比:價格低至0.002元/nt
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