研究基因在代謝通路或某些特定疾病發(fā)生過程中的功能，對于疾病機理研究及藥物研發(fā)具有非常重要的意義。新一代基因編輯技術CRISPR以其操作簡單和通用的獨特優(yōu)勢，成為開展正向遺傳學篩選實驗強有力的工具。利用CRISPR技術建立可能與某類功能相關的突變體庫，通過功能性篩選和富集、PCR擴增及深度測序分析，確認與這類功能相關的基因。
泓迅生物利用獨創(chuàng)的“GPS”（Genotype，Phenotype，Synotype）平臺，提供基于CRISPR sgRNA文庫的一站式基因功能篩選服務。我們專利的Syno?合成技術平臺，可以快速高效地實現(xiàn)sgRNA文庫構建，并包裝成慢病毒混合文庫后轉染細胞。結合高通量/高內涵篩選平臺，利用控制細胞存活、結合免疫染色、流式細胞術等手段篩選得到所需細胞，最終通過測序等方法推斷出發(fā)揮作用的靶基因。
| 服務項目 | 服務詳情 | 周期 |
|---|---|---|
| sgRNA設計 | 針對目標基因群進行sgRNA序列設計 每個基因設計3-6條sgRNA（無物種限制） | 1-2周 |
| 芯片合成 | 將所設計的所有sgRNA及陰性對照合成在一張芯片上 | 3-4周 |
| sgRNA文庫構建 | 將sgRNA構建到客戶的目標載體上 | 2-3周 |
| 文庫質粒大抽 | 根據發(fā)貨量進行轉染級質粒抽提 | 1周 |
| 文庫質檢及NGS驗證 | 庫容量大于100x、覆蓋率>99% 文庫正確率>80%、文庫的均一性<5-10 | 2-3周 |
| 病毒包裝 | 病毒滴度>108TU/mL | 2-3周 |
| 文庫細胞pool構建 | 覆蓋度高達99%、支持任何癌細胞系為目的細胞的構建 | 6-9周 |
| 高通量篩選 | 正向篩選實驗、反向篩選實驗、 藥物抗性實驗、報告基因檢測 | 2-3周 |
| 基因功能分析與驗證 | 文庫QC、樣本相關性、目標基因分析等 | 1-2工作日 |
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